دشمنی ایدئولوژیک گراهام با جمهوری اسلامی ایران محرک اصلی مواضع اوست. او اعتراضات داخلی ایران را یک «فرصت تاریخی» برای تضعیف یا تغییر نظام ایران می‌داند و آشکارا از مداخله نظامی آمریکا حمایت می‌ کند.

جنبش مقاومت اسلامی فلسطین «حماس» به اظهارات سناتور آمریکایی لیندسی گراهام که خواستار بمباران غزه با بمب اتم شده بود، واکنش نشان داد.

نمایندگی ایران در نیویورک نامه‌ای اعتراضی در خصوص اظهارات لیندسی گراهام، سناتور آمریکایی که در بازدید از سرزمین های اشغالی فلسطین در ۱۴ فوریه، در مصاحبه ای با رسانه های رژیم اسرائیل، مقامات آن رژیم را به ترور بیشتر علیه دانشمندان هسته‌ای کشورمان ترغیب کرده بود، به شورای امنیت ارسال کرد.